Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnal1Q05A62 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnal1Q05A62 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnal1Q05A62 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnal1Q05A62 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnal1Q05A62 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnal1Q05A62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnal1Q05A62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnal1Q05A62 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms