Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sox12Q04890 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sox12Q04890 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Sox12Q04890 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sox12Q04890 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sox12Q04890 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sox12Q04890 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Sox12Q04890 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sox12Q04890 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sox12Q04890 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sox12Q04890 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sox12Q04890 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sox12Q04890 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sox12Q04890 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sox12Q04890 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sox12Q04890 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sox12Q04890 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sox12Q04890 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sox12Q04890 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Sox12Q04890 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms