Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1Q04750 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1Q04750 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1Q04750 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1Q04750 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1Q04750 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1Q04750 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top1Q04750 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top1Q04750 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top1Q04750 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top1Q04750 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top1Q04750 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1Q04750 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1Q04750 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms