Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Emx1Q04742 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Emx1Q04742 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emx1Q04742 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emx1Q04742 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms