Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pfdn6Q03958 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfdn6Q03958 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfdn6Q03958 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pfdn6Q03958 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms