Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hivep1Q03172 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hivep1Q03172 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hivep1Q03172 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hivep1Q03172 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms