Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk7Q03147 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk7Q03147 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk7Q03147 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk7Q03147 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk7Q03147 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms