Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax5Q02650 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax5Q02650 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax5Q02650 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 445.7 ms