Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Yy1Q00899 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Yy1Q00899 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Yy1Q00899 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Yy1Q00899 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Yy1Q00899 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Yy1Q00899 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms