Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Brca2P97929 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brca2P97929 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca2P97929 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brca2P97929 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca2P97929 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brca2P97929 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Brca2P97929 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brca2P97929 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca2P97929 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca2P97929 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca2P97929 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca2P97929 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca2P97929 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms