Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smyd1P97443 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smyd1P97443 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smyd1P97443 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smyd1P97443 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smyd1P97443 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd1P97443 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smyd1P97443 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smyd1P97443 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smyd1P97443 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smyd1P97443 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smyd1P97443 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smyd1P97443 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smyd1P97443 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smyd1P97443 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smyd1P97443 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms