Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Meis3P97368 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Meis3P97368 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Meis3P97368 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Meis3P97368 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Meis3P97368 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis3P97368 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis3P97368 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Meis3P97368 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis3P97368 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Meis3P97368 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Meis3P97368 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Meis3P97368 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Meis3P97368 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Meis3P97368 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Meis3P97368 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Meis3P97368 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Meis3P97368 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Meis3P97368 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Meis3P97368 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Meis3P97368 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Meis3P97368 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms