Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SmsP97355 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmsP97355 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmsP97355 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmsP97355 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmsP97355 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmsP97355 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmsP97355 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmsP97355 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SmsP97355 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmsP97355 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmsP97355 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmsP97355 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SmsP97355 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmsP97355 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmsP97355 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmsP97355 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmsP97355 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmsP97355 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmsP97355 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmsP97355 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmsP97355 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmsP97355 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmsP97355 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmsP97355 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmsP97355 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmsP97355 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmsP97355 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmsP97355 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmsP97355 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmsP97355 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmsP97355 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmsP97355 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmsP97355 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmsP97355 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmsP97355 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmsP97355 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmsP97355 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmsP97355 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmsP97355 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmsP97355 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmsP97355 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmsP97355 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmsP97355 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmsP97355 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmsP97355 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmsP97355 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmsP97355 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmsP97355 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmsP97355 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmsP97355 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmsP97355 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmsP97355 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmsP97355 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmsP97355 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmsP97355 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmsP97355 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmsP97355 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmsP97355 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmsP97355 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmsP97355 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmsP97355 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmsP97355 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmsP97355 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmsP97355 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmsP97355 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmsP97355 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmsP97355 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmsP97355 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmsP97355 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmsP97355 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmsP97355 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmsP97355 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmsP97355 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmsP97355 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmsP97355 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmsP97355 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmsP97355 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SmsP97355 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmsP97355 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmsP97355 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmsP97355 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmsP97355 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmsP97355 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmsP97355 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmsP97355 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmsP97355 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmsP97355 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmsP97355 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmsP97355 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmsP97355 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SmsP97355 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SmsP97355 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SmsP97355 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SmsP97355 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SmsP97355 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmsP97355 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmsP97355 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmsP97355 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmsP97355 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms