Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RptnP97347 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RptnP97347 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RptnP97347 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RptnP97347 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RptnP97347 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RptnP97347 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RptnP97347 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RptnP97347 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RptnP97347 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RptnP97347 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RptnP97347 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RptnP97347 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RptnP97347 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RptnP97347 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RptnP97347 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RptnP97347 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RptnP97347 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RptnP97347 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RptnP97347 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RptnP97347 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RptnP97347 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RptnP97347 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RptnP97347 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RptnP97347 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RptnP97347 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RptnP97347 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RptnP97347 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RptnP97347 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RptnP97347 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RptnP97347 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RptnP97347 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RptnP97347 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RptnP97347 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RptnP97347 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RptnP97347 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RptnP97347 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RptnP97347 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RptnP97347 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RptnP97347 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RptnP97347 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RptnP97347 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RptnP97347 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RptnP97347 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RptnP97347 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RptnP97347 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RptnP97347 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RptnP97347 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RptnP97347 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RptnP97347 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RptnP97347 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RptnP97347 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RptnP97347 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RptnP97347 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RptnP97347 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RptnP97347 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RptnP97347 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RptnP97347 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RptnP97347 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RptnP97347 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RptnP97347 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RptnP97347 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RptnP97347 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RptnP97347 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RptnP97347 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RptnP97347 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RptnP97347 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RptnP97347 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RptnP97347 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RptnP97347 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RptnP97347 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RptnP97347 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RptnP97347 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RptnP97347 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RptnP97347 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RptnP97347 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RptnP97347 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RptnP97347 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RptnP97347 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RptnP97347 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RptnP97347 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RptnP97347 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RptnP97347 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RptnP97347 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RptnP97347 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RptnP97347 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RptnP97347 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RptnP97347 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RptnP97347 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RptnP97347 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RptnP97347 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RptnP97347 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RptnP97347 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RptnP97347 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RptnP97347 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RptnP97347 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RptnP97347 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RptnP97347 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RptnP97347 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RptnP97347 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms