Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx1P83917 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx1P83917 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Cbx1P83917 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cbx1P83917 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cbx1P83917 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms