Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgf11P70378 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgf11P70378 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgf11P70378 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgf11P70378 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms