Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkacbP68181 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkacbP68181 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkacbP68181 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkacbP68181 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkacbP68181 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkacbP68181 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkacbP68181 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkacbP68181 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkacbP68181 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkacbP68181 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkacbP68181 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkacbP68181 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkacbP68181 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms