Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps3P62908 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps3P62908 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps3P62908 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps3P62908 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps3P62908 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps3P62908 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps3P62908 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps3P62908 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps3P62908 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps3P62908 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps3P62908 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps3P62908 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps3P62908 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps3P62908 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps3P62908 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps3P62908 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps3P62908 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps3P62908 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps3P62908 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps3P62908 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps3P62908 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3P62908 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3P62908 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps3P62908 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3P62908 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3P62908 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps3P62908 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps3P62908 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps3P62908 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps3P62908 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms