Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tbpl1P62340 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tbpl1P62340 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbpl1P62340 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbpl1P62340 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbpl1P62340 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbpl1P62340 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms