Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ufm1P61961 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ufm1P61961 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ufm1P61961 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms