Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgf1P61148 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgf1P61148 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgf1P61148 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms