Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sem1P60897 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sem1P60897 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sem1P60897 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sem1P60897 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sem1P60897 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sem1P60897 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sem1P60897 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sem1P60897 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sem1P60897 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sem1P60897 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sem1P60897 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sem1P60897 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms