Protein–RNA interactions for Protein: P59808

Sash1, SAM and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash1P59808 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sash1P59808 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sash1P59808 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sash1P59808 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sash1P59808 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sash1P59808 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sash1P59808 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sash1P59808 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sash1P59808 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sash1P59808 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sash1P59808 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sash1P59808 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sash1P59808 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sash1P59808 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sash1P59808 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sash1P59808 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms