Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Csrnp3P59055 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Csrnp3P59055 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Csrnp3P59055 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Csrnp3P59055 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Csrnp3P59055 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Csrnp3P59055 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms