Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paxbp1P58501 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Paxbp1P58501 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Paxbp1P58501 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Paxbp1P58501 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms