Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd4P58467 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd4P58467 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd4P58467 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Setd4P58467 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Setd4P58467 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Setd4P58467 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Setd4P58467 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd4P58467 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Setd4P58467 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd4P58467 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setd4P58467 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setd4P58467 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setd4P58467 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setd4P58467 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Setd4P58467 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setd4P58467 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd4P58467 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd4P58467 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd4P58467 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd4P58467 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd4P58467 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd4P58467 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms