Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samsn1P57725 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Samsn1P57725 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Samsn1P57725 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samsn1P57725 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samsn1P57725 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms