Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn2bP55271 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkn2bP55271 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn2bP55271 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdkn2bP55271 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn2bP55271 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn2bP55271 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn2bP55271 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms