Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Rad23bP54728 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad23bP54728 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad23bP54728 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad23bP54728 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rad23bP54728 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rad23bP54728 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms