Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Efnb1P52795 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efnb1P52795 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efnb1P52795 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Efnb1P52795 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms