Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opn1swP51491 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn1swP51491 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn1swP51491 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opn1swP51491 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms