Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HpdP49429 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HpdP49429 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HpdP49429 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HpdP49429 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HpdP49429 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HpdP49429 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HpdP49429 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HpdP49429 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HpdP49429 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HpdP49429 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HpdP49429 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HpdP49429 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HpdP49429 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HpdP49429 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HpdP49429 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HpdP49429 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HpdP49429 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HpdP49429 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HpdP49429 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HpdP49429 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HpdP49429 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HpdP49429 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HpdP49429 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HpdP49429 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HpdP49429 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HpdP49429 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HpdP49429 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HpdP49429 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HpdP49429 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HpdP49429 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HpdP49429 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HpdP49429 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HpdP49429 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HpdP49429 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HpdP49429 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HpdP49429 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HpdP49429 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HpdP49429 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HpdP49429 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HpdP49429 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HpdP49429 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HpdP49429 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HpdP49429 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HpdP49429 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HpdP49429 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HpdP49429 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HpdP49429 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HpdP49429 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HpdP49429 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HpdP49429 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HpdP49429 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HpdP49429 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HpdP49429 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HpdP49429 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HpdP49429 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HpdP49429 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HpdP49429 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HpdP49429 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HpdP49429 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HpdP49429 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HpdP49429 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HpdP49429 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HpdP49429 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HpdP49429 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HpdP49429 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HpdP49429 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HpdP49429 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HpdP49429 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HpdP49429 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HpdP49429 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HpdP49429 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HpdP49429 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HpdP49429 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HpdP49429 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HpdP49429 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HpdP49429 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HpdP49429 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HpdP49429 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HpdP49429 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HpdP49429 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HpdP49429 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HpdP49429 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HpdP49429 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HpdP49429 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HpdP49429 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HpdP49429 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HpdP49429 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HpdP49429 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HpdP49429 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HpdP49429 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HpdP49429 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HpdP49429 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HpdP49429 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HpdP49429 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HpdP49429 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HpdP49429 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HpdP49429 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HpdP49429 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HpdP49429 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 635.7 ms