Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LmnaP48678 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LmnaP48678 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LmnaP48678 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LmnaP48678 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LmnaP48678 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LmnaP48678 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LmnaP48678 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LmnaP48678 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LmnaP48678 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LmnaP48678 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LmnaP48678 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LmnaP48678 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms