Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax9P47242 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax9P47242 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pax9P47242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax9P47242 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax9P47242 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax9P47242 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax9P47242 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax9P47242 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax9P47242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax9P47242 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax9P47242 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax9P47242 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax9P47242 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax9P47242 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax9P47242 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax9P47242 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax9P47242 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax9P47242 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pax9P47242 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pax9P47242 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax9P47242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax9P47242 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax9P47242 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pax9P47242 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pax9P47242 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax9P47242 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax9P47242 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.9 ms