Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NsfP46460 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NsfP46460 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NsfP46460 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NsfP46460 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NsfP46460 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NsfP46460 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NsfP46460 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NsfP46460 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NsfP46460 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NsfP46460 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsfP46460 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsfP46460 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsfP46460 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsfP46460 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsfP46460 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NsfP46460 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NsfP46460 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NsfP46460 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NsfP46460 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NsfP46460 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsfP46460 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsfP46460 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsfP46460 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsfP46460 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsfP46460 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsfP46460 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsfP46460 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NsfP46460 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NsfP46460 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NsfP46460 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NsfP46460 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NsfP46460 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NsfP46460 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NsfP46460 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NsfP46460 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsfP46460 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsfP46460 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NsfP46460 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NsfP46460 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NsfP46460 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsfP46460 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsfP46460 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsfP46460 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsfP46460 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsfP46460 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NsfP46460 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NsfP46460 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NsfP46460 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NsfP46460 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NsfP46460 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NsfP46460 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NsfP46460 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NsfP46460 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NsfP46460 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NsfP46460 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NsfP46460 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsfP46460 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NsfP46460 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NsfP46460 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsfP46460 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsfP46460 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsfP46460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsfP46460 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsfP46460 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsfP46460 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsfP46460 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsfP46460 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsfP46460 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsfP46460 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsfP46460 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NsfP46460 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsfP46460 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsfP46460 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsfP46460 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NsfP46460 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NsfP46460 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NsfP46460 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsfP46460 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsfP46460 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsfP46460 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsfP46460 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsfP46460 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NsfP46460 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NsfP46460 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NsfP46460 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NsfP46460 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsfP46460 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsfP46460 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsfP46460 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsfP46460 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NsfP46460 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NsfP46460 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NsfP46460 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NsfP46460 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NsfP46460 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NsfP46460 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NsfP46460 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NsfP46460 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NsfP46460 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms