Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThpoP40226 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThpoP40226 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThpoP40226 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThpoP40226 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThpoP40226 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThpoP40226 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThpoP40226 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThpoP40226 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThpoP40226 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThpoP40226 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThpoP40226 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ThpoP40226 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ThpoP40226 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThpoP40226 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ThpoP40226 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ThpoP40226 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ThpoP40226 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ThpoP40226 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ThpoP40226 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ThpoP40226 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms