Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ptpn1P35821 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn1P35821 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn1P35821 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn1P35821 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn1P35821 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms