Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn11P35235 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn11P35235 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpn11P35235 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptpn11P35235 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ptpn11P35235 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms