Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxa10P31310 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa10P31310 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa10P31310 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa10P31310 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms