Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa4P28311 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa4P28311 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa4P28311 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa4P28311 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa4P28311 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms