Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RdxP26043 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RdxP26043 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RdxP26043 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RdxP26043 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RdxP26043 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RdxP26043 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RdxP26043 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RdxP26043 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RdxP26043 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RdxP26043 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RdxP26043 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RdxP26043 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RdxP26043 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RdxP26043 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RdxP26043 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RdxP26043 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RdxP26043 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RdxP26043 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RdxP26043 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RdxP26043 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RdxP26043 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RdxP26043 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RdxP26043 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RdxP26043 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RdxP26043 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RdxP26043 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RdxP26043 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RdxP26043 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RdxP26043 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RdxP26043 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RdxP26043 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RdxP26043 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RdxP26043 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RdxP26043 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RdxP26043 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RdxP26043 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RdxP26043 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RdxP26043 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RdxP26043 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RdxP26043 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RdxP26043 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RdxP26043 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RdxP26043 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RdxP26043 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RdxP26043 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RdxP26043 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RdxP26043 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RdxP26043 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RdxP26043 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RdxP26043 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RdxP26043 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RdxP26043 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RdxP26043 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RdxP26043 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RdxP26043 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RdxP26043 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RdxP26043 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RdxP26043 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RdxP26043 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RdxP26043 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RdxP26043 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RdxP26043 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RdxP26043 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RdxP26043 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RdxP26043 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RdxP26043 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RdxP26043 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RdxP26043 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RdxP26043 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RdxP26043 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RdxP26043 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RdxP26043 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RdxP26043 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RdxP26043 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RdxP26043 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RdxP26043 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RdxP26043 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RdxP26043 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RdxP26043 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RdxP26043 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RdxP26043 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RdxP26043 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RdxP26043 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RdxP26043 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RdxP26043 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RdxP26043 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RdxP26043 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RdxP26043 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RdxP26043 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RdxP26043 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RdxP26043 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RdxP26043 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RdxP26043 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RdxP26043 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RdxP26043 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RdxP26043 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RdxP26043 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RdxP26043 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RdxP26043 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms