Protein–RNA interactions for Protein: P24860

Ccnb1, G2/mitotic-specific cyclin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1P24860 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnb1P24860 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnb1P24860 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnb1P24860 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnb1P24860 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnb1P24860 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnb1P24860 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnb1P24860 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnb1P24860 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnb1P24860 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms