Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx3P23198 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx3P23198 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx3P23198 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx3P23198 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms