Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edn1P22387 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn1P22387 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn1P22387 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn1P22387 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn1P22387 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn1P22387 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn1P22387 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn1P22387 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Edn1P22387 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn1P22387 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn1P22387 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms