Protein–RNA interactions for Protein: P16332

Mut, Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MutP16332 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MutP16332 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MutP16332 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MutP16332 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MutP16332 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MutP16332 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MutP16332 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MutP16332 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MutP16332 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MutP16332 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MutP16332 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MutP16332 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MutP16332 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MutP16332 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MutP16332 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MutP16332 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MutP16332 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MutP16332 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MutP16332 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MutP16332 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MutP16332 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MutP16332 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MutP16332 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MutP16332 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MutP16332 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MutP16332 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MutP16332 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MutP16332 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MutP16332 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MutP16332 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MutP16332 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MutP16332 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MutP16332 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MutP16332 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MutP16332 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MutP16332 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MutP16332 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MutP16332 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MutP16332 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MutP16332 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MutP16332 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MutP16332 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MutP16332 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MutP16332 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MutP16332 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MutP16332 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MutP16332 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MutP16332 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MutP16332 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MutP16332 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MutP16332 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MutP16332 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MutP16332 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MutP16332 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MutP16332 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MutP16332 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MutP16332 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MutP16332 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MutP16332 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MutP16332 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MutP16332 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MutP16332 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MutP16332 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MutP16332 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MutP16332 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MutP16332 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MutP16332 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MutP16332 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MutP16332 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MutP16332 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MutP16332 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MutP16332 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MutP16332 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MutP16332 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MutP16332 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MutP16332 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MutP16332 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MutP16332 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MutP16332 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MutP16332 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MutP16332 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MutP16332 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MutP16332 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MutP16332 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MutP16332 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MutP16332 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MutP16332 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MutP16332 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MutP16332 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MutP16332 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MutP16332 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MutP16332 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MutP16332 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MutP16332 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MutP16332 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MutP16332 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MutP16332 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MutP16332 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MutP16332 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MutP16332 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms