Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Schip1P0DPB4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Schip1P0DPB4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Schip1P0DPB4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Schip1P0DPB4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Schip1P0DPB4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Schip1P0DPB4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms