Protein–RNA interactions for Protein: P08730

Krt13, Keratin, type I cytoskeletal 13, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt13P08730 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt13P08730 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt13P08730 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt13P08730 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt13P08730 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt13P08730 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt13P08730 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt13P08730 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt13P08730 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt13P08730 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt13P08730 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt13P08730 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt13P08730 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt13P08730 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt13P08730 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt13P08730 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt13P08730 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms