Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01823 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01823 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01823 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01823 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01823 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01823 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01823 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01823 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01823 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01823 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01823 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01823 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01823 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01823 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01823 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01823 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01823 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01823 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01823 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01823 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01823 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01823 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01823 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01823 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01823 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01823 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01823 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01823 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01823 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01823 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01823 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01823 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01823 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01823 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01823 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01823 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01823 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01823 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01823 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01823 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01823 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01823 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01823 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01823 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01823 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01823 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01823 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01823 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01823 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01823 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01823 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01823 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01823 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01823 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01823 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01823 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01823 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01823 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01823 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01823 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01823 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01823 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01823 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01823 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01823 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01823 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01823 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01823 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01823 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01823 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01823 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01823 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms