Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01808 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01808 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01808 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01808 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01808 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01808 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01808 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01808 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01808 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01808 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01808 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01808 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01808 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01808 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01808 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01808 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01808 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01808 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01808 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01808 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01808 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01808 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01808 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01808 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01808 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01808 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01808 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01808 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01808 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01808 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01808 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01808 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01808 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01808 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01808 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01808 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01808 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01808 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01808 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01808 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01808 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01808 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01808 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01808 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01808 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01808 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01808 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01808 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01808 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01808 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
P01808 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
P01808 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01808 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01808 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01808 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01808 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01808 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01808 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P01808 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01808 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01808 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01808 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01808 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01808 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P01808 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01808 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01808 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
P01808 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01808 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01808 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01808 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01808 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01808 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01808 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01808 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01808 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01808 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01808 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01808 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01808 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01808 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01808 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01808 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01808 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01808 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01808 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
P01808 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01808 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01808 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01808 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01808 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01808 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01808 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01808 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01808 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01808 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01808 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01808 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
P01808 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms