Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01757 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01757 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01757 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01757 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01757 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01757 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01757 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01757 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01757 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01757 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01757 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01757 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01757 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01757 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01757 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01757 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01757 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01757 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01757 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01757 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01757 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01757 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01757 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01757 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01757 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01757 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01757 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01757 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01757 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01757 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01757 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01757 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01757 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01757 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01757 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01757 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01757 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01757 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01757 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01757 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01757 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01757 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01757 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01757 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01757 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01757 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01757 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01757 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01757 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01757 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01757 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01757 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01757 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01757 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01757 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01757 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01757 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01757 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01757 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01757 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01757 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01757 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01757 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01757 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01757 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01757 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01757 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01757 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01757 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01757 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01757 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01757 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01757 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01757 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01757 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01757 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01757 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01757 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01757 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01757 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01757 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01757 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01757 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01757 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01757 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01757 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01757 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01757 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms